Laboratorio de Secuenciación Masiva

Las instalaciones del área de Genómica se dividen en dos secciones: el laboratorio de Biología Molecular, ubicado en el edificio principal de ITER; y la infraestructura de supercomputación, ubicada en el edificio del NAP.

El laboratorio se distribuye en tres estancias debidamente compartimentadas: el laboratorio de Biología Molecular propiamente dicho, la sala de secuenciación y la zona de despachos. De esta forma, el flujo de trabajo en el área de Genómica comienza con la preparación de las muestras en el laboratorio de Biología Molecular, continúa con la secuenciación masiva en la sala de secuenciación,  y procesado de datos en el superordenador teideHPC, para terminar en la zona de despachos, donde los datos son procesados por el equipo científico del área de Genómica.

Los equipos con los que cuenta el laboratorio de secuenciación son:

  • 1 COVARIS M220 Focused-ultrasonicator (COVARIS Inc.)
  • 1 CFX96 Touch Real-Time PCR detection system (BioRad)
  • 2 Mastercycler pro S (Eppendorf)
  • 1 Qubit 3.0 Fluorometer (Thermo Fisher Scientific)
  • 1 Agilent 4200 TapeStation system (Agilent Technologies)
  • 1 NanoDrop One spectrophotometer (Thermo Scientific)
  • 1 cBot 2 System (Illumina, Inc.)
  • 1 MiSeq Sequencing system (Illumina, Inc.)
  • 1 NextSeq550 sequencing system (Illumina, Inc,)
  • 1 HiSeq 4000 sequencing system (Illumina, Inc.)
  • 1 Novaseq 6000 sequencing system (Illumina, Inc.)
  • 1 MinION sequencing system (Oxford Nanopore Technologies, Ltd.)
  • 1 MinION M1kC sequencing system (Oxford Nanopore Technologies, Ltd.)
  • 1 GridIONx5 sequencing system (Oxford Nanopore Technologies, Ltd.)
  • 1 Voltrax system (Oxford Nanopore Technologies, Ltd.)
  • 1 Freedom EVO100 automation system (TECAN)